Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms