Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPP1Q1MSJ5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPP1Q1MSJ5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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