Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ASIC2Q16515 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC2Q16515 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms