Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8Q15843 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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