Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRADDQ15628 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRADDQ15628 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms