Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GAPVD1Q14C86 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
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