Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 RELA-225ENST00000534558 692 ntTSL 514.78□□□□□ -0.043e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.063e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.093e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.093e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CLPTM1-210ENST00000589158 749 ntTSL 414.4□□□□□ -0.13e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RNPEPL1-208ENST00000486058 3126 ntTSL 214.31□□□□□ -0.123e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 IP6K2-207ENST00000416707 1260 ntTSL 1 (best)14.26□□□□□ -0.133e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RELA-206ENST00000525858 754 ntTSL 214.18□□□□□ -0.143e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.152e-8■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.193e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.23e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 IP6K2-220ENST00000449563 580 ntTSL 413.8□□□□□ -0.23e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 R3HDM2-206ENST00000429355 2266 ntTSL 513.78□□□□□ -0.23e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RELA-203ENST00000525301 623 ntTSL 313.73□□□□□ -0.213e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RELA-210ENST00000527074 585 ntTSL 213.72□□□□□ -0.213e-7■□□□□ 9.7
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PUM1Q14671 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.243e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.272e-11■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.293e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 IP6K2-209ENST00000424035 568 ntTSL 413.01□□□□□ -0.333e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 IP6K2-214ENST00000436134 631 ntTSL 313.01□□□□□ -0.333e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 WDR60-203ENST00000444851 2769 ntTSL 1 (best)13.01□□□□□ -0.331e-7■□□□□ 9.7
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PUM1Q14671 IP6K2-213ENST00000434860 560 ntTSL 412.94□□□□□ -0.343e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 IP6K2-225ENST00000455545 539 ntTSL 312.81□□□□□ -0.363e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.362e-11■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.362e-11■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 ERICH1-207ENST00000522893 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.68□□□□□ -0.382e-8■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.41e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.43e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.413e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.423e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 WDR60-205ENST00000467220 5410 ntTSL 212.41□□□□□ -0.421e-7■□□□□ 9.7
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PUM1Q14671 IP6K2-208ENST00000417896 1124 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.483e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 IP6K2-219ENST00000446860 1565 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.53e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 BRD3-206ENST00000494743 507 ntTSL 311.93□□□□□ -0.57e-10■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 IP6K2-218ENST00000443964 973 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.53e-7■□□□□ 9.7
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PUM1Q14671 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.573e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RELA-219ENST00000532879 567 ntTSL 511.47□□□□□ -0.573e-7■□□□□ 9.7
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PUM1Q14671 R3HDM2-203ENST00000393811 3778 ntTSL 1 (best)11.17□□□□□ -0.623e-7■□□□□ 9.7
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PUM1Q14671 IP6K2-210ENST00000431721 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.683e-7■□□□□ 9.7
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PUM1Q14671 RELA-212ENST00000527874 578 ntTSL 49.42□□□□□ -0.93e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 R3HDM2-207ENST00000441731 4076 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.023e-7■□□□□ 9.7
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PUM1Q14671 DMTF1-228ENST00000579850 3483 ntTSL 54.59□□□□□ -1.673e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.847e-10■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 TOP3B-213ENST00000457179 3061 ntTSL 512.63□□□□□ -0.393e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.473e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 TOP3B-210ENST00000444502 4163 ntTSL 29.85□□□□□ -0.833e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 VTI1B-201ENST00000216456 1103 ntTSL 1 (best)23.49■■□□□ 1.351e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.241e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 MCM7-211ENST00000491245 648 ntTSL 1 (best)9.96□□□□□ -0.828e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 VTI1B-206ENST00000556461 576 ntTSL 28.35□□□□□ -1.071e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 VTI1B-203ENST00000554636 565 ntTSL 34.79□□□□□ -1.641e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 HNRNPM-206ENST00000596984 664 ntTSL 519.27■□□□□ 0.681e-15■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 HNRNPM-215ENST00000601645 832 ntTSL 313.02□□□□□ -0.331e-15■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 HNRNPU-229ENST00000640440 871 ntTSL 315.13■□□□□ 0.012e-30■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 SMARCA4-212ENST00000586985 534 ntTSL 514.68□□□□□ -0.061e-9■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 GOLGA4-206ENST00000435830 4152 ntTSL 1 (best)9.38□□□□□ -0.916e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RPL35-203ENST00000487431 785 ntTSL 1 (best)23.09■■□□□ 1.292e-56■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.092e-56■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RPL35-204ENST00000493018 692 ntTSL 312.57□□□□□ -0.42e-56■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RPL35-202ENST00000373570 493 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.782e-56■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 DNMT1-224ENST00000591764 341 ntTSL 1 (best)9.15□□□□□ -0.946e-13■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 SRSF11-205ENST00000460795 528 ntTSL 25.93□□□□□ -1.463e-31■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 SF3A1-205ENST00000463818 583 ntTSL 220.02■□□□□ 0.83e-11■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 SF3A1-207ENST00000471342 459 ntTSL 29.28□□□□□ -0.923e-11■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RPS8-208ENST00000497035 694 ntTSL 314.16□□□□□ -0.141e-66■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 STRN4-218ENST00000600358 1267 ntTSL 515.39■□□□□ 0.056e-7■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 STRN4-210ENST00000594847 814 ntTSL 315.08■□□□□ 06e-7■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 STRN4-217ENST00000599231 568 ntTSL 213.38□□□□□ -0.276e-7■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.133e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 KDELR2-205ENST00000463747 376 ntTSL 512□□□□□ -0.493e-6■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 KDELR2-202ENST00000382267 583 ntTSL 49.88□□□□□ -0.833e-6■□□□□ 9.6
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