Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
EIF4EBP1Q13541 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP1Q13541 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms