Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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