Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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ERCC8Q13216 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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ERCC8Q13216 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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ERCC8Q13216 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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ERCC8Q13216 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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ERCC8Q13216 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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ERCC8Q13216 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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