Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB2Q08289 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB2Q08289 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB2Q08289 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB2Q08289 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNB2Q08289 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNB2Q08289 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB2Q08289 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB2Q08289 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNB2Q08289 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB2Q08289 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB2Q08289 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB2Q08289 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CACNB2Q08289 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB2Q08289 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB2Q08289 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB2Q08289 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB2Q08289 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB2Q08289 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB2Q08289 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB2Q08289 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB2Q08289 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB2Q08289 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB2Q08289 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms