Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms