Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA52P62987 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA52P62987 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA52P62987 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA52P62987 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA52P62987 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA52P62987 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBA52P62987 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBA52P62987 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBA52P62987 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBA52P62987 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBA52P62987 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBA52P62987 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBA52P62987 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBA52P62987 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBA52P62987 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBA52P62987 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBA52P62987 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBA52P62987 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBA52P62987 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBA52P62987 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms