Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms