Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms