Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIP4K2AP48426 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms