Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AFMP43652 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AFMP43652 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFMP43652 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFMP43652 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFMP43652 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFMP43652 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFMP43652 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFMP43652 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFMP43652 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms