Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPD2P43304 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPD2P43304 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPD2P43304 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPD2P43304 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPD2P43304 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPD2P43304 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPD2P43304 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPD2P43304 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPD2P43304 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPD2P43304 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPD2P43304 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPD2P43304 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPD2P43304 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPD2P43304 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPD2P43304 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPD2P43304 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPD2P43304 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPD2P43304 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPD2P43304 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPD2P43304 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPD2P43304 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPD2P43304 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPD2P43304 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPD2P43304 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPD2P43304 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPD2P43304 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms