Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNB1P35222 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms