Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms