Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms