Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CREB1P16220 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CREB1P16220 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CREB1P16220 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CREB1P16220 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB1P16220 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB1P16220 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB1P16220 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB1P16220 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB1P16220 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB1P16220 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms