Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms