Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms