Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC3P02656 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC3P02656 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC3P02656 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC3P02656 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC3P02656 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOC3P02656 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOC3P02656 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOC3P02656 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms