Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRD1O95696 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRD1O95696 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRD1O95696 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRD1O95696 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRD1O95696 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRD1O95696 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRD1O95696 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD1O95696 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD1O95696 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD1O95696 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD1O95696 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD1O95696 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD1O95696 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD1O95696 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD1O95696 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRD1O95696 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRD1O95696 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRD1O95696 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms