Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX3O75364 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX3O75364 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITX3O75364 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITX3O75364 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITX3O75364 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITX3O75364 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITX3O75364 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITX3O75364 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms