Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM4AO75164 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms