Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SPAG9O60271 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
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