Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms