Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CRXO43186 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRXO43186 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRXO43186 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRXO43186 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRXO43186 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRXO43186 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRXO43186 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRXO43186 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRXO43186 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRXO43186 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRXO43186 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRXO43186 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRXO43186 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CRXO43186 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CRXO43186 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CRXO43186 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms