Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F3O00716 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F3O00716 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F3O00716 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F3O00716 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F3O00716 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F3O00716 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F3O00716 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F3O00716 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F3O00716 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F3O00716 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F3O00716 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F3O00716 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F3O00716 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F3O00716 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F3O00716 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F3O00716 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F3O00716 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F3O00716 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms