Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
J3QQQ9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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J3QQQ9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QQQ9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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J3QQQ9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QQQ9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QQQ9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QQQ9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QQQ9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QQQ9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QQQ9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QQQ9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QQQ9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QQQ9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QQQ9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QQQ9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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J3QQQ9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
J3QQQ9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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J3QQQ9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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J3QQQ9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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J3QQQ9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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J3QQQ9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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J3QQQ9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
J3QQQ9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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