Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF316A6NFI3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF316A6NFI3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms