Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA8A3KMH1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VWA8A3KMH1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms