Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VPS4AQ9UN37 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS4AQ9UN37 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms