Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALD1Q9ULE6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms