Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms