Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLCO3A1Q9UIG8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms