Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms