Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTLNQ9NXG0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms