Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms