Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN4Q9NRL3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms