Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms