Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms