Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms