Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NDC1Q9BTX1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDC1Q9BTX1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms