Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LARP6Q9BRS8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms