Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDF4Q9BRK5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms