Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms